ヨーヨーの最高到達点からストリングに乗るまでを追いかけるのは忙し過ぎます。
こちらの映像をあわせてご覧ください。
https://www.youtube.com/watch?v=9RbeiNHkGUE
基本的にはヨーヨーの挙動とストリングをあわせて見るようにします。はじめのうちはストリングを短くし、少しずつ感覚をつかんでくると、ヨーヨーを飛ばした先に視線を合わせるのではなく、力加減に応じてヨーヨーが飛ぶ先を予想して視線を（体感では先回りして）合わせることができるようになります。
ストリング全長分ヨーヨーを安定して飛ばせるようになると、その頃にはヨーヨーを目で追うのも、多少ストリングから目が外れても手の感覚でストリングの位置がわかるようになってきます。